（ＪＲ中央線・山手線・中央総武各駅停車線・埼京線・湘南新宿ライン、小田急線、京王線、東京メトロ丸ノ内線、都営新宿線・大江戸線）
東口側がアルタ、歌舞伎町などの繁華街方面。
西口側がヨドバシカメラなどの西新宿繁華街、都庁などの超高層ビル街方面。
南口・新南口側がルミネ・タカシマヤタイムズスクエア・紀伊國屋書店・ＪＲ東日本本社方面。
この３方面さえ把握しておけば、大体目的地に行けるが、間違えると大回りをしなければならなくなる。
埼京線（主に南行き、渋谷・大崎・りんかい線新木場方面）・湘南新宿ライン（横浜・大船・平塚・小田原方面および鎌倉、逗子方面）
２番線：
埼京線（主に南行き、渋谷・大崎・りんかい線新木場方面）
湘南新宿ライン（横浜・大船・平塚・小田原方面および鎌倉、逗子方面）
３番線：
埼京線（主に北行き、池袋・大宮・川越方面）
湘南新宿ライン（池袋・大宮・宇都宮方面および川越方面）
東武日光線方面直通特急「日光」「きぬがわ」（各スペーシア）
「成田エクスプレス」（成田空港方面）
４番線：
埼京線（主に北行き、池袋・大宮・川越方面）
湘南新宿ライン（池袋・大宮・宇都宮方面および川越方面）
東武日光線方面直通特急「日光」「きぬがわ」（各スペーシア）
「成田エクスプレス」（成田空港方面）
５番線：中央本線特急「あずさ」「スーパーあずさ」「かいじ」（甲府・松本方面）
６番線：中央本線特急「あずさ」「スーパーあずさ」「かいじ」（甲府・松本方面）
７番線：中央線（東京方面）
８番線：中央線（東京方面）
９番線：中央線（立川・高尾方面、青梅・五日市線方面）・中央ライナー・青梅ライナー
１０番線：中央線（立川・高尾方面、青梅・五日市線方面）
１１番線：中央総武各駅停車線（御茶ノ水・千葉方面）
１２番線：山手線（渋谷・品川方面）
１３番線：山手線（池袋・上野方面）
１４番線：中央総武各駅停車線（中野・三鷹方面）
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２番線：線（笹塚・明大前・多摩センター・京王八王子・高尾山口・橋本方面方面）
３番線：線（笹塚・明大前・多摩センター・京王八王子・高尾山口・橋本・多摩動物園方面）
４番線：京王新線（初台・明大前・調布・多摩センター・橋本方面）
５番線：都営新宿線（神保町・大島・本八幡方面）
６番線：都営大江戸線（六本木・両国方面）
７番線：都営大江戸線（光が丘方面）
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２番線：特急ロマンスカー（小田原方面）
３番線：特急ロマンスカー（小田原方面）
４番線：快速急行・急行・準急（登戸・小田原方面）
５番線：快速急行・急行・準急（登戸・小田原方面）
６番線：降車ホーム
７番線：降車ホーム
８番線：区間準急・各駅停車（登戸・小田原方面）
９番線：区間準急・各駅停車（登戸・小田原方面）
１０番線：降車ホーム
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２番線：丸の内線（大手町・池袋方面）
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